研究

現在の主な研究内容

巨大ウイルスのゲノム解析

  • 自然界には細胞性生物に匹敵するほどの粒子経・ゲノム長を誇る巨大なウイルスがいます。なぜ単純なはずのウイルスが、それほどまでに巨大なのか?どのように進化の道のりを経てきたのか?生態系での役割は?そんなことを中心課題として研究を進めています。
  • 現在は、温泉から分離された巨大ウイルスの研究(東京理科大・武村政春教授との共同研究)、全てのtRNA種を保持するジャンボファージの研究(広島大学名誉教授、山田隆先生との共同研究)を進めています。

海洋微生物メタゲノム解析

  • 地球スケールの超大規模オミクスデータ・環境データから、生態系における種間相互作用が生態系動態と環境変動におよぼす影響を解明するための研究をしています。
  • 例えば、生物炭素ポンプ(プランクトンが深海に沈降することによる二酸化炭素の海洋への吸収)にウイルスが影響を与えているのかについて研究を進めています。
  • 注目しているのは海洋だけではありません。大腸癌、潰瘍性大腸炎、慢性膵炎に着目して腸内の細菌を研究しています。近畿大学の櫻井先生らのグループとの共同研究です。腸内細菌の相互作用が、健常者と患者ではどのように異なるのかについて明らかにしたいと考えています。

新しいバイオ情報技術の開発研究

  • オミクスデータを統合するインターネットリソース「ゲノムネット」を開発しています。
  • ウイルスゲノム解析システム(ViPTree)の開発。
  • さらにパワフルなウイルス分類システムの開発を目指しています。
  • オーソログデータベースの開発(DBCLS五斗先生との共同)。KEGGオーソログの自動割り当てシステムについて研究しています。
  • メタゲノム解析システムMAPLEのサービス提供(JAMSTEC高見先生、DBCLS五斗先生との共同)。
  • 抗原変異データベース(varDB)の提供(DBCLS五斗先生による開発)。

データベースプロジェクト

  • DBGET/LinkDB: ゲノムネット統合データベース検索システム
  • KEGG/MGENES: メタゲノムデータベース
  • Virus-Host DB: ウイルスと宿主のデータベース

公開データ・ソフトウェア等