Greeting from Ogata Lab. Institute for Chemical Research, Kyoto University緒方研究室からのごあいさつ

環境微生物サンプルからDNAとRNAを簡便に抽出できる手法を開発し、短報として報告しました。様々な環境サンプルのメタゲノムやメタトランスクリプトーム解析に役立つ手法として活用されることを期待しています。論文リンク：https://doi.org/10.1264/jsme2.ME22102

昨夏の調査に引き続いて、とかち鹿追ジオパーク推進協議会にご協力いただき、南山大学等の研究者らと共同で、岡﨑先生が然別湖の調査を行いました。凍った湖に穴を空けて、約100mの水深から採水を行い、得られた微生物サンプルのメタゲノム解析を進めていきます。

同グループは、九州南部–琉球列島付近の黒潮内側から流軸域にかけて観測を行い、海水DNA/RNA試料の採取やマリンスノーキャッチャーによる凝集粒子捕集、ウイルス溶菌の定量化実験を行いました。

この論文では、南北2000 km以上にわたる黒潮上流–下流域の主要な植物プランクトン系統の一つであるハプト藻類の分布や地理起源、生態特性を明らかにしました。国内特許を取得した連続自動海水濾過システム（発明者 鈴木光次 北海道大学教授他）、定量的DNAメタバーコーディング、およびナノモル濃度レベルの高感度栄養塩分析等の先端技術が用いられました。これら複合的手法によりオミックスデータに定量的な情報を付与することが可能となり、今後、環境DNA分析が定量性を鍵とする海洋物質循環の文脈で活用されることが期待されます。

リンク: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/mec.16734